Datei zum downloaden generieren

[nti]

Hallo,
ich habe ein Javaprogramm geschrieben, welches Dateien ausliest und diese als Binär-Code in der Konsole ausgibt. Meine PHP-Anwendung soll diesen Binär-Code einlesen und daraus eine Instanz der ursprünglichen Datei erzeugen und zum Download anbieten. Leider funktioniert das nicht so ganz wie ich mir das vorstelle. Die Dateien lassen sich zwar downloaden, aber nicht öffnen (z.B zip-Dateien) oder sie enthalten falsche Formatierungen (Word Dateien).
Hier ist mein verwendeter Code:
Java:

public class DateiInBinärtext{ 

    public static void main(String args [])throws Exception {
String s = "";
        DataInputStream in = new DataInputStream(new FileInputStream(args[0]));  //Datei.doc wird übergeben
        String line;
        while ((line = in.readLine()) != null){
              System.out.println(line);
            }
}
} 

PHP:

<?php
...
function echoFile($file) {
  header("Content-type: ".mimeType($file));
  header("Content-Disposition: inline; filename=".basename($file));
  system(escapeshellcmd("DateiInBinär.exe Datei.doc"));
exit;
}
echoFile("Datei.doc");

?>

Hat jemad eine Idee, wie ich das richtig zum laufen bekomme?
Vielen Dank im Vorraus,

nti

[dani_o]

vielleicht ist deine deklaration für das word-format nicht korrekt?